個人醫療帳戶資金以參保人的年齡、在職和退休的不同情況作為劃分標準，按照醫保年度計入。上海市實行的醫保年度為每年4月1日至第二年的3月31日。
在職人員個人繳納的基本醫保費全部計入本人的個人醫療帳戶。用人單位繳納的基本醫保費的30%左右計入個人醫療帳戶。
2016醫保年度用人單位繳納的基本醫保費計入部分，按下列標準分別計入：在職職工（1）34歲以下的，計入標準為140元；（2）35至44歲的，計入標準為280元；（3）45歲以上的，計入標準為420元。退休人員（1）退休至74歲以下的，計入標準為1120元；（2）75歲以上的，計入標準為1260元。
個人醫療帳戶資金的計入。
（1）職工在醫保年度起始前已參加醫保的，其個人醫療帳戶計入一年的資金；在醫保年度中途參保的，其個人醫療帳戶按實際參保次月起至所在醫保年度末的實際月數，計算并計入資金。
（2）用人單位和職工補繳以前醫保年度欠繳的醫保費后，職工個人醫療帳戶應當按照《上海市職工基本醫保辦法》的有關規定補計資金，補計的資金計入其個人醫療帳戶的歷年帳戶中。
（3）醫保年度初計入職工個人醫療帳戶資金，在醫保年度末，需根據本醫保年度職工實際繳費情況和職退變更情況進行清算，少計入的予以補足，多計入的予以扣除。補計的資金計入其個人醫療帳戶的歷年帳戶中。
